mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CCATGCTTCCTTGCATTCAATA TGGAATGTAAAGAAGTATGGAG TTCAGCCTTTGAGAGTTCCATGCTTCCTTGCATTCAATAGTTATATTCAAGCATATGGAATGTAAAGAAGTATGGAGCGAAATCTGGCGAG 2 0 5' arm Drosophila_melanogaster mirbase mir-1 4e-25 dme-mir-1 1e-46 -36.2 ....(((...((..((((((((((((.((((((((.((((((.......))).))).)))))))).))))))))))))....)).)))... (-36.20)