mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGGGAATAGTTGCTGTGCTGTA TATCACAGTGGCTGTTCTTTTT TTTAATGTAGAGGGAATAGTTGCTGTGCTGTAAGTTAATATACCATATCTATATCACAGTGGCTGTTCTTTTTGTACCTAAA 3 0 5' arm Drosophila_melanogaster mirbase mir-6 2e-32 dme-mir-6-1 2e-41 -25.7 .......(((((((((((((..(((((.((((..(...........)..)))).)))))..)))))))))))))........ (-25.70)