mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAGTACTTATGTCATACTACGC TGAGTATTACATCAGGTACTGGT TACGGTTGAGTATTACATCAGGTACTGGTGTGCCTTAAATCCAACAACCAGTACTTATGTCATACTACGCCGTG 3 1 3' arm Drosophila_melanogaster mirbase mir-12 3e-28 dme-mir-12 1e-36 -29.4 ((((((..(((((.((((.((((((((((((............)).)))))))))))))).)))))..)))))) (-29.40)