mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CGCTATGCTGCATCTAGTCAGT TGGCAAGATGTCGGCATAGCTGA TCCGTTGGTAAATTGGCAAGATGTCGGCATAGCTGACGTTGAAAAGCGATTTTGAAGAGCGCTATGCTGCATCTAGTCAGTTGTTCAATGGA 2 1 3' arm Drosophila_melanogaster mirbase mir-31 1e-43 dme-mir-31a 3e-47 -40.3 ((((((((..(((((((.(((((.(((((((((...((((....))))..((....))..)))))))))))))).)))))))..)))))))) (-40.30)