mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACAAGTTTTGATCTCCGGTAT TCCCTGAGACCCTAACTTGTGA GACATGTGCAAATGTTTGTATGGCTGATTCCCTGAGACCCTAACTTGTGACTTTTAATACCAGTTTCACAAGTTTTGATCTCCGGTATTGGACGCAAACTTGCTGATGTT 5 1 3' arm Drosophila_melanogaster mirbase lin-4 3e-32 dan-mir-125 6e-58 -31.7 (((((..((((..((((((....(..((..((.((((.(..(((((((((..((.......))..)))))))))..).)))).)).))..)..))))))))))..))))) (-31.70)