mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGTGGGACTTTCGTCCGTTT CCGGATGATGGTTCACAACGACC GTAATGGTACGGTGCGACCGGATGATGGTTCACAACGACCGTGTCATTTAAACGGGTCGGTGGGACTTTCGTCCGTTTGTAACGCCATTTGTCAACGA 3 1 3' arm Drosophila_melanogaster mirbase mir-278 5e-40 dme-mir-278 8e-51 -37.2 ..((((((....(((((.(((((((.(((((.((.(((((.(((.......)))))))).))))))).))))))).)))))..))))))......... (-37.20)