mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGACTAGATCCACACTCATTAA AGTGGGTGGGGGTCCAGTGTTTCACA GGAATTCATACTACTGTTTTTAGTGGGTGGGGGTCCAGTGTTTCACATTGATTTTCTTAGTATTTGTGACTAGATCCACACTCATTAATAACGGTAGTTC 2 4 3' arm Drosophila_melanogaster mirbase mir-279 2e-45 dme-mir-279 5e-52 -36.4 .........(((((((((.((((((((((.(((((.((....(((((...(((.....)))...))))))).))))).)))))))))).))))))))).. (-36.40)