mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGTATTTACGTTGCATATGAAATGATA TTATTTTATATGCAGGTATATGCAAG TGGCTTTTATGTATTTACGTTGCATATGAAATGATATTTATAGTAAACAGATTATTTTATATGCAGGTATATGCAAGTCGAGGTCCTCCACACTG 2 1 5' arm Drosophila_melanogaster mirbase mir-280 5e-37 dse-mir-280 3e-44 -25.6 .((((((..(((((.(((.((((((((((((((((.((((...))))...))))))))))))))))))).)))))....)))))).......... (-25.60)