mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGCGAATGTCGGTATGGTCTCT GTTTCGATTAAGCGAAGTGACTAGACCGAACACTCGTGCT TTAAAATTGAATGGCGAATGTCGGTATGGTCTCTTTTTCAAAGAAAGGTTTCGATTAAGCGAAGTGACTAGACCGAACACTCGTGCTATAATTTTAAAAT 4 18 5' arm Drosophila_melanogaster mirbase mir-286 3e-41 dme-mir-286 5e-52 -27.3 (((((((((....((((.(((((((.(((((.(((((.....))))).(((((......))))).))))).)))).))).))))....)))))))))... (-27.30)