mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CGGCACATGTTGAAGTACACTCA ATTGTACTTCATCAGGTGCTCTGGT CATGTCTATTGTACTTCATCAGGTGCTCTGGTGTGTCTCGTAACCCGGCACATGTTGAAGTACACTCAATATG 5 2 3' arm Drosophila_melanogaster mirbase mir-305 5e-30 dme-mir-305 5e-36 -24.5 (((((..(.(((((((((.((.(((((..((.((........))))))))).)).))))))))).)..))))) (-24.50)