mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCAGGTACTTAGTGACTCTCAA TTGGGGGTCACTCTGTGCCTGTGC GTCCACTCGATGGCTCAGGTACTTAGTGACTCTCAATGCTTTTGACATTTTGGGGGTCACTCTGTGCCTGTGCTGCCAGTGGGAC 3 2 5' arm Drosophila_melanogaster mirbase mir-306 1e-40 dme-mir-306 4e-43 -43.5 .((((((.(..(((.(((((((..(((((((((((((((....).)))..)))))))))))..))))))).)))..))))))).. (-43.50)