mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CGGACGGTATATGGGTTAATATT ATATTGCACATTCACCGGCCTGAA TCTAGATCATTTTTCGGACGGTATATGGGTTAATATTTCATTTGTCGAATATATTGCACATTCACCGGCCTGAAAATATCAAGA 4 3 5' arm Drosophila_melanogaster mirbase 100 dme-mir-311 2e-42 -19.9 (((.(((...(((((((.((((..(((.((.((((((((.......))).))))))).)))..))))..))))))).))).))) (-19.90)