mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTTTCGAGCAATAATTGAAACC TTTTGATTGTTGCTCAGAAAGCC CACTTATATAATTTTGATTGTTGCTCAGAAAGCCCTCATTGTTTACCAGTTGGCTTTCGAGCAATAATTGAAACCAGATAAGTG 4 1 3' arm Drosophila_melanogaster mirbase mir-315 6e-27 dme-mir-315 2e-42 -34.8 (((((((....(((..((((((((((.(((((((...((((.....)))).)))))))))))))))))..)))....))))))) (-34.80)