mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGGATACACCCTGTGCTCGCT TGAACACAGCTGGTGGTATCCAGT ATGCAACTGCCATTGGGATACACCCTGTGCTCGCTTTGAATGAAATGCAAGCAAGTGAACACAGCTGGTGGTATCCAGTGGCCGTTTGGCAT 4 2 5' arm Drosophila_melanogaster mirbase mir-317 8e-45 dme-mir-317 3e-47 -38.6 ((((.((.(((((((((...(((((((((.((((((.(..((.....))..))))))).)))))..))))...))))))))).))...)))) (-38.60)