mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCACATGCAACATCCCTTAC TCTGGGTGTTGCGTTGTGTG TACAAACACAAGATTTTCTGGGTGTTGCGTTGTGTGTACCTGTGTACAGGCGTATTCACATGCAACATCCCTTACATCTTGCTTGAT 6 1 3' arm Drosophila_melanogaster mirbase 100 dme-mir-954 3e-44 -31.1 ..(((...((((((.....(((((((((((((.(((..((((....))))..))).)).))))))))))).....)))))).))).. (-31.10)