mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTGTTTGGAATGGTCTCGTTAGCT TTTCGAGACCACTCTAATCCATTG GATCGTTATCGTGTTTGGAATGGTCTCGTTAGCTAACGGATGAGCAAGTGCTCGGCTCACTGGCCCAAATGCAGTTTGCCCGGAGACGCCGGTTAACCCAGCACTGAAATGTGTAGTTTCGAGACCACTCTAATCCATTGCAGCATTT 3 2 5' arm Drosophila_melanogaster mirbase 100 dme-mir-956 2e-80 -48.1 ....(((.(.(((.(((((.((((((((..(((((.((.((...((.(((((.((...((((((......((.....))..(....)))))))...)).)))))))..)).))))))).)))))))).)))))..))).).))).... (-48.10)