mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGTACTCCCTCCGTCCCAGTA CTGAGACGGAGGGAGTACAAT CGATCCTTCCTCTGTACTCCCTCCGTCCCAGTATATAAGGCGTAACCACCTCTGGTTCAAAGACCAAGAAATGCATTTAATTGTCTCTATACCACTGCATCGATATGCGTATGCATAGAGAGAGCACGCCTTATATTGTGGGACAAGAATAAAAAGTGGTTACGCCTTATATCCTGAGACGGAGGGAGTACAATACAAAAGGG GAAGCAAAACTCCTCAGTTTCTACAGGAAACAAAACACAGCTCGCAGCTAATTACAGTACAACTTAATTAATTAATACTCGATCCTTCCTCTGTACTCCCTCCGTCCCAGTATATAAGGCGTAACCACCTCTGGTTCAAAGACCAAGAAATGCATTTAATTGTCTCTATACCACTGCATCGATATGCGTATGCATAGAGAGAGCACGCCTTATATTGTGGGACAAGAATAAAAAGTGGTTACGCCTTATATCCTGAGACGGAGGGAGTACAATACAAAAGGGCCACCTACCCACCAGTATGCATGTATCCATCCATATTCAGCTCCATGAACAATCCTGAATTTCTAGCAAAATATACTTCTGTTTGATTCTACCCATGTGCATTTCCCCATGTGCATTTAATTTCCAGAGGCAGGAAATCTCCATCGACCCCGCACCAAAAACCGCCACTCTGCTCGGGAAGCAACGGACCCGATCTCCTGCAATGCTGAACACTGAACTGACGAATGACGAGTAGGCGAGTAGCCACTAGCCAGCCAGGCCACGAAAACGCTCATCTCCGCGTGCGCACCGAGGTGGTCCTCCTCTCCGGGTCCAGCGGGCCGTGCCCCTGCCCTGGCGCCGCC 2 0 5' arm Zea_mays mirnest MIR806 0.0002 100 -77.3 ...(((((....(((((((((((((((.(((.(((((((((((((((((.(((((((....)))).)))......((((.(((((((.(((....(((.((..(((((....)))))..))..))).......)))...)))))))...))))..))))))))))))))))).))).)))))))))))))))......))))) (-77.3)