mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGTCATCGGGGGTATTATGAA TTAGTACTCGGGTTGATAAAG TTAACTTTGTTCTATATTCTTAGTACTCGGGTTGATAAAGACCTTTTCTTCAGGGAGCCTTTGTCATCGGGGGTATTATGAAATATAGTTTAAAGAAA 5 0 3' arm Drosophila_melanogaster mirbase 100 dme-mir-959 8e-51 -29.2 ....(((((..((((((((.((((((((..(.((((((((.((((......))))...)))))))).)..)))))))).).)))))))..)))))... (-29.20)