mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATACGGTCTGGGACACTTTTA TGAGTATTCCAGATTGCATAGC GGGTTTTGTACCACATTCTGAGTATTCCAGATTGCATAGCTTTGTGCTACTATTGCTATACGGTCTGGGACACTTTTAACATGGTATCAAATC 4 0 3' arm Drosophila_melanogaster mirbase 100 dme-mir-960 7e-48 -32.8 .(((((.((((((..((..((((.((((((((((.(((((..((......))..))))).)))))))))).))))..))..)))))).))))) (-32.80)