mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACAAGGTAAATATCAGGTTGTTTC AACATCTGTATATACCTTTGTTC TTAGTCTAATCTAAAACAAGGTAAATATCAGGTTGTTTCCTGTATTCGATCGAAACATCTGTATATACCTTTGTTCCGATTGGACAAAA 1 3 5' arm Drosophila_melanogaster mirbase 100 dme-mir-963 2e-45 -27.3 ...((((((((...(((((((((.(((.(((((.(((((............))))))))))))).)))).)))))..)))))))).... (-27.30)