mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGTTAAAAGCCTCTGTTCTAAG TAGAATAGGGGAGCTTAACTTA CAATAACATATTGGTCCAACTTGCCTTAGAATAGGGGAGCTTAACTTATGTTTTTGATGTTTAAGTTAAAAGCCTCTGTTCTAAGACAATTTGATGATCA 3 0 3' arm Drosophila_melanogaster mirbase 100 dme-mir-964 5e-52 -31.62 ...........((((((((.(((.(((((((((((((...((((((((.............))))))))...))))))))))))).))).)))..))))) (-31.62)