mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAAGCGTATAGCTTTTCCCCTT GGGGTAAAACTGTACGTTATATG GACAATATTGCTCAACATTTTGGGGGGTAAAACTGTACGTTATATGTGCCCTTCTGTGATATTCATAAGCGTATAGCTTTTCCCCTTAAAAGTTAGAGCTATTGCAA 0 3 3' arm Drosophila_melanogaster mirbase 100 dme-mir-965 4e-56 -36.43 (.(((((..(((((((.((((((((((.(((((((((((((.((((.................))))))))))))).))))))))))))))))).)))))))))).. (-36.43)