mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCTTCCCGAACTCAGGCTAA ACACTGAATTTGGGGGGAATT TACATGTGAGGATGTCACAAATACACTGAATTTGGGGGGAATTCTTATGTATATACAAATTCTTCCCGAACTCAGGCTAATTTTGTGGCATCCGT 6 0 3' arm Drosophila_melanogaster mirbase 100 dme-mir-979 5e-49 -40.1 .........((((((((((((....((((.(((((((((((((..(((....)))..))))))))))))).))))......)))))))))))).. (-40.10)