mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CCCCTTGTTGCAAACCTCACGC GTGTGATTTGTAGCAAAGTGAT GACGGCGGTACCGGGCATTTTGGGTGTGTGATTTGTAGCAAAGTGATATGTATTTGATCATCCCCTTGTTGCAAACCTCACGCCAAAGATGATCTGCGA 6 0 3' arm Drosophila_melanogaster mirbase mir-988 1e-46 dme-mir-988 2e-51 -31.1 ....((((.......((((((.((((((.(.((((((((((.(((((.........)))))....)))))))))).).)))))).))))))..)))).. (-31.10)