mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTAAAGTTGTAGTTTGGAAAGT TTTCCCAACTACACCTATTAATA TATCACTGCAGTTTCAGGCTTTTCCCAACTACACCTATTAATACATATTTTAACGTCCTATTAAAGTTGTAGTTTGGAAAGTTTTGGTTTTGCATT 3 1 3' arm Drosophila_melanogaster mirbase 100 dme-mir-991 1e-49 -25.46 ......(((((..(((((.((((((.(((((((.((.((((((...............)))))))).))))))).)))))).)))))..))))).. (-25.46)