mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGACTAGATTTCATGCTCGTCT GCGAACATGGATCTAGTGCACG TCTGACTCTATTTTGTCGGCGAACATGGATCTAGTGCACGGTGGTTCATGATTAAGTTCGTGACTAGATTTCATGCTCGTCTATTAAGTTGGGTCAG 2 2 3' arm Drosophila_melanogaster mirbase mir-996 6e-46 dme-mir-996 3e-50 -36.99 .(((((((.((((.((.(((((.((((((((((((.(((((................))))))))))).)))))).))))).)).)))).))))))) (-36.99)