mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTGCTGGGTCGGGGCATTAACA ATATTGTCCTGTCACAGCAGTA GACGCTTGCCATTGATATTGTCCTGTCACAGCAGTATTGTAACACTATATTATAGTTTACTGCTGGGTCGGGGCATTAACATTGTTGAGCGTCATTAGCA 4 0 3' arm Drosophila_melanogaster mirbase 100 dme-mir-1000 5e-52 -41.3 (((((((..((.((.((.(((((((.(.((((((((((((((.......)))))))..))))))).).))))))).)).)).))..)))))))....... (-41.30)