mature_miRNA	miRNA*	pre-miRNA	EST_contig	mismatches	bulges	arm	species	source_database	RFAM_best_hit	RFAM_lowest_evalue	miRBase_best_hit	miRBase_lowest_evalue	folding_energy	secondary_structure
ATACTCTCTCTGTCCCAAAAT TTTGGGACAGATGGAGTAGAT GATTTTACATAATACTCTCTCTGTCCCAAAATATAATTTGTTTTAGACTACAGATACATTCATTAATCAACATATGAATGTAGTTGGTATGTAACTATGTATGTCTACATTCATTATTATTCATTCGAATGTGAACAGAAAAAAAGAGGGCTAGAAAGAACTATATTTTGGGACAGATGGAGTAGATTACTATAC CATTCAGCTAGCGAGCGAGAGAGAGGGGAACAAAAAGGAGGGGCGAGGAGGACAGGGAGCCGAGCGCAAGAGCTGAGGCTTCGCCGCGAAACCCCAGACCTCGCGCCGCCCCTTCCCCTCCGCGGCGTCGTCCTCGCACGCTCTCCGATCCAAGATGTATAAGCTGGGGAGAGGAAACCGCGACAAGGTGCAGCAGTTCATGACCATTACCGGCGCCAGTGAGAAGGTTGCCCTTCAGGCACTGAAAGCTAGTGATTGGCACTTGGAAGGAGCTTTTGACTTCTTCTATAGCCAACCTCAGGTTTCTGTGGTCAATACTCGGCATCTTGAAGATATTTTCAACAGATATAAAGAACCTGATGCTGATATGATAATGGTGGAAGGAATATCTCAATTTTGCAATGATCTGCAGGTAAGGAGCATTTATTTTCATCTGTAAATATCCGTTCACCATCTTCGCACTTCATTTCCAGCCATAGGCATATGGAGCGCATAATCCATTTTATTGAAAATAGAAGGTACCATTTTAATGGTTAATTGCTACCACAAATGTGTTTAGATTTTACATAATACTCTCTCTGTCCCAAAATATAATTTGTTTTAGACTACAGATACATTCATTAATCAACATATGAATGTAGTTGGTATGTAACTATGTATGTCTACATTCATTATTATTCATTCGAATGTGAACAGAAAAAAAGAGGGCTAGAAAGAACTATATTTTGGGACAGATGGAGTAGATTACTATACTATGAAGCTA 2 0 5' arm Zea_mays mirnest MIR1122 0.00005  100 -52.5 ............((((((.((((((((((((((((.(((.((((((.((.....(((((((............((((((((((...((((((....))))))..))))))))))............))))))).............))..)))))).))).)))))))))))))))).))))))........... (-52.5)