mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAAATTCGATTTCTTATTCATAG GTGAGTTTGAAATTGAAATGCGTAAA GTGAGTTTGAAATTGAAATGCGTAAATTGTTTGGTACAATTTAAATTCGATTTCTTATTCATAG 6 3 3' arm Drosophila_melanogaster mirbase 100 dme-mir-1006 9e-31 -19.7 ((((((..(((((((((.....((((((((.....))))))))..)))))))))..)))))).. (-19.70)