mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AATTTACTTCCAAGCTAACTGA TCTTAGCTTGGCAATAAAATAT TCGTTTAAGATGCTGTGAATATCCCGTTTTCTTAGCTTGGCAATAAAATATTATTCACAGAAACTAGTAATTTACTTCCAAGCTAACTGAAGGGGATATTCAGTGCAACCACGGA 6 0 3' arm Drosophila_melanogaster mirbase 100 dme-mir-2280 7e-61 -38 ((((....(.(((..((((((((((.(((..(((((((((...((((.((((((((...)))..))))).))))...)))))))))..))).))))))))))..))).).)))). (-38.00)