mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATTATCTGCAGCTGCAGATGCAA GTATCTGTATCTGCAGTATTGC GGATGTCGAGCAGTACACGTATTATCTGCAGCTGCAGATGCAAATGTATATGTATCTGTATCTGTATCTGCAGTATTGCAGTATCGCTGCTTTATTCATATCC 3 1 5' arm Drosophila_melanogaster mirbase 100 dme-mir-2281 9e-54 -39.3 ((((((.(((((((..(((((.((.((((((.((((((((((.(((......))).)))))))))).)))))))).))).))...))))))).....)))))) (-39.30)