mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTAAGTGCACCAGATTGGGAA CCCAGTAATGTCCACTTACAA TCCATCTTCCGACCGGCGATCAGTAAGTGCACCAGATTGGGAATAACCTTCAAAAGCTGCAACTTAAATATTCCCAGTAATGTCCACTTACAAGGAGCCCCTGGTTGGATGGGTGGA 4 0 5' arm Drosophila_melanogaster mirbase 100 dme-mir-2494 5e-62 -45 ((((((((((((((((.(.((.(((((((.((...((((((((((.......................))))))))))...)).)))))))...))..).))))))))).))))))) (-45.00)