mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAAGCTGCCAGCATGATCTG GGTCGTGCTGTAGTTTCATC ATGTGGTGGTGCACCACGAGTTGGTGAAGCTGCCAGCATGATCTGGTTATGATGGGGGGGGTATATGTAAAATGGATGTAATCTATACTACTACCGGCCCCTGTCACTCTCTCTCTCTCCCCCGTCCCTGAGTGTCATATATGGATCGACGAATCCAAGATGAGAGGGGAGGGGAGAGAGAGAGAGGGTAATTAATGAGCACCAGGACCAGGTCGTGCTGTAGTTTCATCTGCTGGGGGCCGCACATCAAA CCTCTCTCTCGGATAGCTAGTTCTTCTTCCTCCTTCCTCCGTTTGGATCAGACAAGAGGGTATGTGGTGGTGCACCACGAGTTGGTGAAGCTGCCAGCATGATCTGGTTATGATGGGGGGGGTATATGTAAAATGGATGTAATCTATACTACTACCGGCCCCTGTCACTCTCTCTCTCTCCCCCGTCCCTGAGTGTCATATATGGATCGACGAATCCAAGATGAGAGGGGAGGGGAGAGAGAGAGAGGGTAATTAATGAGCACCAGGACCAGGTCGTGCTGTAGTTTCATCTGCTGGGGGCCGCACATCAAAAACCCTAGCTAGCTCACCCTCCTGCAATTCATATCCGTGCTGCACTCGCCAGAGACCACCAGTCAAGCTAGCTTATTTCCGCCGTTGACGACGTTGATTAATTATCCGTGATAATAATGGCCTTGTCGATCTAGTTTCCTCTCTCTTTTTTTATTATTATGCCTTTGCTTCTCTCTTGGCTCGGGTGTGTATATTGCTGTCTCTGTCTTCGTCCTCACTGTGTGCCTACAATCCTGCTCACGATAATGCAGATGGGAAGTTGTGCATTGCCGGATGTCTTCTTTTCAAAGGT 0 1 5' arm Zea_mays mirnest MIR167_1 9e-38 zma-MIR167g 1e-42 -108.2 (((((.((((...((...(((.(((((((((((.((((((((((((((.(((((((((.((((...(((..((((((...))))))..)))))))..)))))))))((((((((((((((((..(((((.....((((...(((((......)))))..))))..)))))))))))))))))))))(((...........)))..))))))))))))))))))))))))).))).)).))))))))).... (-108.2)