mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGTCGTGCTGTAGTTTCATCT GTGAAGCTGCCAGCATGATCTG TGTGGTGGTGCACCACGAGTTGGTGAAGCTGCCAGCATGATCTGGTTATGATGGGGGGGGTATATGTAAAATGGATGTAATCTATACTACTACCGGCCCCTGTCACTCTCTCTCTCTCCCCCGTCCCTGAGTGTCATATATGGATCGACGAATCCAAGATGAGAGGGGAGGGGAGAGAGAGAGAGGGTAATTAATGAGCACCAGGACCAGGTCGTGCTGTAGTTTCATCTGCTGGGGGCCGCACATCAA CCTCTCTCTCGGATAGCTAGTTCTTCTTCCTCCTTCCTCCGTTTGGATCAGACAAGAGGGTATGTGGTGGTGCACCACGAGTTGGTGAAGCTGCCAGCATGATCTGGTTATGATGGGGGGGGTATATGTAAAATGGATGTAATCTATACTACTACCGGCCCCTGTCACTCTCTCTCTCTCCCCCGTCCCTGAGTGTCATATATGGATCGACGAATCCAAGATGAGAGGGGAGGGGAGAGAGAGAGAGGGTAATTAATGAGCACCAGGACCAGGTCGTGCTGTAGTTTCATCTGCTGGGGGCCGCACATCAAAAACCCTAGCTAGCTCACCCTCCTGCAATTCATATCCGTGCTGCACTCGCCAGAGACCACCAGTCAAGCTAGCTTATTTCCGCCGTTGACGACGTTGATTAATTATCCGTGATAATAATGGCCTTGTCGATCTAGTTTCCTCTCTCTTTTTTTATTATTATGCCTTTGCTTCTCTCTTGGCTCGGGTGTGTATATTGCTGTCTCTGTCTTCGTCCTCACTGTGTGCCTACAATCCTGCTCACGATAATGCAGATGGGAAGTTGTGCATTGCCGGATGTCTTCTTTTCAAAGGT 1 1 3' arm Zea_mays mirnest MIR167_1 9e-38 zma-MIR167g 1e-42 -107.9 .((((((((...((...(((.(((((((((((.((((((((((((((.(((((((((.((((...(((..((((((...))))))..)))))))..)))))))))((((((((((((((((..(((((.....((((...(((((......)))))..))))..)))))))))))))))))))))(((...........)))..))))))))))))))))))))))))).))).)).))))).)))... (-107.9)