mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGCGGTGGCCGCCGCTCTGGGAGT TCCTCGAGCTGCTCACCGCCTT ATGACCGGCGAGGAGATGCGATTCCTCGAGCTGCTCACCGCCTTTGGCTTGGACATCGAGGCGGTGGCCGCCGCTCTGGGAGTCGATATGCACACGCTCAACA 2 2 3' arm Drosophila_melanogaster mirbase 100 dme-mir-4941 9e-54 -44.1 ......((((.((.....((((((((.((((.((((((((((((((.......))..))))))))))..)).)))).)))))))).....).).))))..... (-44.10)