mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAACACAGTGCTAAATGAAAGA TTTTATTTTCTCTGTGTTTTCA TTCGGATCGTTTGAATGACCAATTTTGTCTTTTATTTTCTCTGTGTTTTCAGTTAATGAAAGATAGTGAACACAGTGCTAAATGAAAGATAATGAGACCCAGTCGACAGGACCCAAG 3 1 3' arm Drosophila_melanogaster mirbase 100 dme-mir-4943 5e-62 -28.34 ...((.((.(((((.((.......(((((((((((((.(.((((((((.(.(((.......))).).)))))))).)..))))))))))))).......)).)))).).)).))... (-28.34)