mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTAGTTACAGCTGCAGGAAGAA TTTTCTGCTTCTGCCGCTGAGC AAAAGTAACTTTCGTAATCGAAAAAGTTTCGCTTTTTTTTCTGCTTCTGCCGCTGAGCAAGTTTTAAATATTACCGCTTAGTTACAGCTGCAGGAAGAAAAGTTATAATTATGGACTACGTACATAAAT 4 0 3' arm Drosophila_melanogaster mirbase 100 dme-mir-4944 7e-55 -34.13 .........(((((....))))).......((((((((((((((..(((..(((((((.................)))))))..)))..)))))))))))))).....(((((.........))))).. (-34.13)