mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAAGCTGCCAGCATGATCTG GGTCATGCTGTAGTTTCATC AGAGGGTATGTAGTGGTGCACCACGAGTTGGTGAAGCTGCCAGCATGATCTGGTTCTGATGGTGNGTGGTATATGTAAGATGGATGTAATCTATACTACGGCCCCTGTTAATTTCTCTCTCTCTCCCCGGTCCCTGACTGTCATATATGGATCGACGAATCCAAATGAGAGGNGAAATGGAGAGAGAGNAGAGAGAGGGTAATTATGAGCACCAGNACCAGGTCATGCTGTAGTTTCATCTGCTGGTGGCCGCACATCGAAAACCCTA ATCTATCCCCCGCTCTCTCCATCTCTCTACCCTTTCTCTCTCTCGGATAGCTAGCTCTTCTTCTTCCTCCTTCCTCCGTTTGGATCAGACGAGAGGGTATGTAGTGGTGCACCACGAGTTGGTGAAGCTGCCAGCATGATCTGGTTCTGATGGTGNGTGGTATATGTAAGATGGATGTAATCTATACTACGGCCCCTGTTAATTTCTCTCTCTCTCCCCGGTCCCTGACTGTCATATATGGATCGACGAATCCAAATGAGAGGNGAAATGGAGAGAGAGNAGAGAGAGGGTAATTATGAGCACCAGNACCAGGTCATGCTGTAGTTTCATCTGCTGGTGGCCGCACATCGAAAACCCTAGCTAGCTAACTAGCCTCATCCTCGTGCAATTCATATCCATGCTGCACTCGGCCAGACCACCAGTCAAGCTAGCTTATTTCCGGCCGTTGACAACGCTGATTAAATTATTTCCGGATAAAAATGGCCCTTGCCAATCCAATTTCCCCCCCCCCCTTTTTTAAAAAAAGCCCTTGCCTCTCCCCCTTGGGTCCCGGTTGGGATTGGGCTGTCCTCCCCCACCCA 0 1 5' arm Zea_mays mirnest MIR167_1 5e-55 zma-MIR167g 2e-38 -96.9 ..(((((........((((.((((.(((.(((((((((((.(((((((((((((.(((...((..(((((...((((..((((((...))))))..))))((((.......((((((((((((((.(((.(((((.....((((...(((((......))))).)))).))).))..))).))))))).))))))))))).)))))..))..))).)))))))))))))))))))))))).))).))))..)))).......))))). (-96.9)