mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATACCCGAGCCATGATAGATTG ATCGATCGCGGTTCGAGTGCTCG TTGGCGCTTGGAATCGATACCCGAGCCATGATAGATTGAAGTCAACCCAATCGATCGCGGTTCGAGTGCTCGAGTCTTGTGCGCCGGCATG 3 1 5' arm Drosophila_melanogaster mirbase 100 dme-mir-4954 1e-46 -38.8 .((((((..(((.(((((((.((((((.((((.(((((.........))))).)))).)))))).))).)))).)))...))))))..... (-38.80)