mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CGCGGAGAAAAAAATCCCCAGA TGGGGCTTTTTTTCTCCGTGCA CACCGATTTGCTTCCCCTTTTTCCGTGCGCGGAGAAAAAAATCCCCAGAAACATAATATCAGGATGCTCTCTATCTCTGTCTCTGTCTAACGCTTAATTGTTGCTCAATTGCGAATTAATGTCTGGGGCTTTTTTTCTCCGTGCAGTGCCATAGCCGTAACCACAACCT 1 0 5' arm Drosophila_melanogaster mirbase 100 dme-mir-4955 7e-68 -48.5 .......((((..............((((((((((((((((.(((((((....((((..(((((((.....)))).)))...........(((..(((((.....)))))))).))))...))))))).))))))))))))))))..((....)).))))......... (-48.50)