mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGTCATGCTGTAGTTTCATCT GTGAAGCTGCCAGCATGATCTG ATGTAGTGGTGCACCACGAGTTGGTGAAGCTGCCAGCATGATCTGGTTCTGATGGTGGTGGTATATGTAAGATGGATGTAATCTATACTACGGCCCCTGTTAATTTCTCTCTCTCTCCCCGGTCCCTGACTGTCATATATGGATCGACGAATCCAAGATGAGAGGGGAATGGAGAGAGAGAGAGAGGGTAATTATGAGCACCAGGACCAGGTCATGCTGTAGTTTCATCTGCTGGTGGCCGCACATCGAA AATTCATCTATCCCCCGCTCTCTCCATCTCTCTACCCTTTCTCTCTCTCGGATAGCTAGCTCTTCTTCTTCCTCCTTCCTCCGTTTGGATCAGACGAGAGGGTATGTAGTGGTGCACCACGAGTTGGTGAAGCTGCCAGCATGATCTGGTTCTGATGGTGGTGGTATATGTAAGATGGATGTAATCTATACTACGGCCCCTGTTAATTTCTCTCTCTCTCCCCGGTCCCTGACTGTCATATATGGATCGACGAATCCAAGATGAGAGGGGAATGGAGAGAGAGAGAGAGGGTAATTATGAGCACCAGGACCAGGTCATGCTGTAGTTTCATCTGCTGGTGGCCGCACATCGAAAACCCTAGCTAGCTCTAGTAGCTAGCTCATCCTCGTGCAATTCATATCCATGCTGCACTCGCCAGACCACCAGTCAAGCTAGCTTATTTCCGCCGTTGACGACGTTGATTAATTATTCGTGATAATAATAGCCTTGTCGATCTAGTTTCGTCTCTCTCTTTTTATTATTATGCCTTTGCTTCTCTCTTGGTTCGGTTGTGTATTGCTGTCTTGGTCATCACTGTGTGCCTACATACGATTTCACTGTGTGATCCTTCCTGCTCACGATAATGCAGATGGTGGGAAGCTGTGCATTGCCGGAAGTCTTCTTTTCGAAGGTCAAAAAAAAAAAAAAA 1 1 3' arm Zea_mays mirnest MIR167_1 2e-78 zma-MIR167g 2e-56 -102.6 ........((((.((((.(((.(((((((((((.(((((((((((((((((.((..((.(((....(((..((((((...))))))..))).))))).((((.((((((((((((((.(((.(((((.....((((...(((((......)))))..))))..))))).))).)))))))))))))).))))......)).)))))))))))))))))))))))))))).))).))))..))))...... (-102.6)