mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GCGGATTGTCGCTGGGCAGCGG GATGGCCAGCAACAACTCGCTG AGGGGGCGGCAACATGTGCCACCTGCCGCCGATGGCCAGCAACAACTCGCTGAATAATCTCTGCGGATTGTCGCTGGGCAGCGGTGGTAGTGATGATCTCATGAACGATCCTCGGGC 5 0 3' arm Drosophila_melanogaster mirbase 100 dme-mir-4956 5e-62 -53.3 .(((((((....((((.(.((((((((((((.((.(((((.((((..(((.((......)).)))..)))).))))).)).))))))))).).))..).))))..)).))))).... (-53.30)