mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAAGCTGCCAGCATGATCTG GGTCATGCTGTAGTTTCATC GAGGGTATGTAGTGGTGCACCACGAGTTGGTGAAGCTGCCAGCATGATCTGGTTCTGATGGTGGTGGTATATGTAAGATGGATGTAATCTATACTACGGCCCCTGTTAATTTCTCTCTCTCTCCCCGGTCCCTGACTGTCATATATGGATCGACGAATCCAAGATGAGAGGGGAATGGAGAGAGAGAGAGAGGGTAATTATGAGCACCAGGACCAGGTCATGCTGTAGTTTCATCTGCTGGTGGCCGCACATCGAAAACCCT AATTCATCTATCCCCCGCTCTCTCCATCTCTCTACCCTTTCTCTCTCTCGGATAGCTAGCTCTTCTTCTTCCTCCTTCCTCCGTTTGGATCAGACGAGAGGGTATGTAGTGGTGCACCACGAGTTGGTGAAGCTGCCAGCATGATCTGGTTCTGATGGTGGTGGTATATGTAAGATGGATGTAATCTATACTACGGCCCCTGTTAATTTCTCTCTCTCTCCCCGGTCCCTGACTGTCATATATGGATCGACGAATCCAAGATGAGAGGGGAATGGAGAGAGAGAGAGAGGGTAATTATGAGCACCAGGACCAGGTCATGCTGTAGTTTCATCTGCTGGTGGCCGCACATCGAAAACCCTAGCTAGCTCTAGTAGCTAGCTCATCCTCGTGCAATTCATATCCATGCTGCACTCGCCAGACCACCAGTCAAGCTAGCTTATTTCCGCCGTTGACGACGTTGATTAATTATTCGTGATAATAATAGCCTTGTCGATCTAGTTTCGTCTCTCTCTTTTTATTATTATGCCTTTGCTTCTCTCTTGGTTCGGTTGTGTATTGCTGTCTTGGTCATCACTGTGTGCCTACATACGATTTCACTGTGTGATCCTTCCTGCTCACGATAATGCAGATGGTGGGAAGCTGTGCATTGCCGGAAGTCTTCTTTTCGAAGGTCAAAAAAAAAAAAAAA 0 1 5' arm Zea_mays mirnest MIR167_1 3e-78 zma-MIR167g 3e-56 -107.6 .(((((........((((.((((.(((.(((((((((((.(((((((((((((((((.((..((.(((....(((..((((((...))))))..))).))))).((((.((((((((((((((.(((.(((((.....((((...(((((......)))))..))))..))))).))).)))))))))))))).))))......)).)))))))))))))))))))))))))))).))).))))..)))).......))))) (-107.6)