mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGTACGTATTTATTTGTCTGCA AAGGCGAATAAATATGTATTTATG ATTTTTGAATGGTCCTTTTCATGCCCAAGGCGAATAAATATGTATTTATGTATATTTTTTTATATGGTACGTATTTATTTGTCTGCAAATGGCTGCCAAGGAGTGCTACATA 3 1 3' arm Drosophila_melanogaster mirbase 100 100 -32.8 ..........(.(((((..((.(((..(((((((((((((((((((.(((((........))))))))))))))))))))))))......)))))..))))).)........ (-32.80)