mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCACACCACACACTCACTCACC AGATGAGCGCCTGATGTGATG CACAAGGTGATCGATGGGAGATGAGCGCCTGATGTGATGATGAAGTAGATCGATCACACCACACACTCACTCACCCAGGTTTCATCC 5 1 3' arm Drosophila_melanogaster mirbase 100 dme-mir-4965 3e-44 -27.4 .....(((((....((((.((((((.(..((.(((((((((.......))).)))))).))..).)))).)).))))....))))). (-27.40)