mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GATCATGTTGCAGCTTCACTC TTGAAGCTGCCAGCATGATCTG AACACTTCGCTGGTGTGAGAGCTTGAAGCTGCCAGCATGATCTGGCTGCTCAAACGCCGCCGGCCTCCCAAGTGCTCGATCGGTGGCGCTTCACCAGATCATGTTGCAGCTTCACTCTCTCGCAACCAGCGAAGGG CCAATGCAACCTCCGTCCGTGCATGGCTCGCGCAGTCGTGCTCTGATTTCGTCTCGTCCTCCCGCCGTCCCCTTGCCTTCGCACACGCCAAAACTTTAGCTGCACATATGCTCTCCTCACTCCTCTTCTGCTCGTCTGGGAGTCCCAAATCCGGGTGGGGAAGAAAGAACACTTCGCTGGTGTGAGAGCTTGAAGCTGCCAGCATGATCTGGCTGCTCAAACGCCGCCGGCCTCCCAAGTGCTCGATCGGTGGCGCTTCACCAGATCATGTTGCAGCTTCACTCTCTCGCAACCAGCGAAGGGCGGCAAAGCACCGTGGAGGCTCCGGACAATGAATTCCTTCGCCGGAGGCACTCGCATTGACGTCGCTCATCGACGACTAGAAGAAGCTTGGTGACTGCCAGTTCAACCTCTAGAAGCAGTACTACCGTGGCCG 2 1 3' arm Zea_mays mirnest MIR167_1 4e-60 zma-MIR167i 1e-68 -70.8 ....(((((((((((((((((..(((((((((.((((((((((((.((...((.(((((((((..((..........))))))))))).)))))))))))))))))))))))))..))))))).)))))))))).. (-70.8)