mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATCACAGCCAGCTTTGATGAGC TCTCAAAGAGGCTGTGAAATG GCTGAGCTCTCAAAGAGGCTGTGAAATGCATTTTGAAAGCTTTGCGAGCATATCACAGCCAGCTTTGATGAGCTTAGC 2 2 3' arm Drosophila_mojavensis mirbase mir-2 2e-35 dgr-mir-2a-1 3e-25 -39.27 (((((((((((((((.((((((((.((((..................)))).))))))))..)))))).))))))))) (-39.27)