mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATCACAGCCAGCTTTGATGGGC CATCAAAAAGGGCTGAGAATGATATT TACTTTCAGTGTCATCAAAAAGGGCTGAGAATGATATTTCTGTAATTGAATTGTATCACAGCCAGCTTTGATGGGCACTGCGAAGGG 3 5 3' arm Drosophila_mojavensis mirbase mir-2 1e-24 dgr-mir-2c 5e-30 -31.1 ..(((((((((((((((((...(((((....(((((((((.......)))..)))))))))))...)))))).))))))).)))).. (-31.10)