mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCCACAGGCTTTCTTGAACTG GTTCAAGAAAGCCCATGGAAA GCGGGCATGCTTTCCACAGGCTTTCTTGAACTGTGAACTCGTGGGCGTGGTGGTGGTGGTGCTGGTGCTGGGTGTGTGGGACGGAATGATTGGCTCCTCCCAGTCCCAGTCCCAGTCCCACCCACCAATTCTCTTCCCCCCGACCGGCCGTGAATTGAATTGAATCGAATCGCATCGCTGAGCTTCCCCCCGGCTCGCTCACGCGACCTGTTGATGGTTCAAGAAAGCCCATGGAAACCATGCAGC GCAAATCTCTCTCTCTCTCTCCATCTCTCCACACACAGCCCCTTCGCTGCCGAGGTCCCTCGCCGGACGGGGGGTGAAGGACGAAGGGGAAGAAAGGTGCGCGGGCATGCTTTCCACAGGCTTTCTTGAACTGTGAACTCGTGGGCGTGGTGGTGGTGGTGCTGGTGCTGGGTGTGTGGGACGGAATGATTGGCTCCTCCCAGTCCCAGTCCCAGTCCCACCCACCAATTCTCTTCCCCCCGACCGGCCGTGAATTGAATTGAATCGAATCGCATCGCTGAGCTTCCCCCCGGCTCGCTCACGCGACCTGTTGATGGTTCAAGAAAGCCCATGGAAACCATGCAGCCTCCCTCCTGTGCAGCTGTGCTCTGGTGGCGGAGAATTCCGCCGGTTCCGGGTGAGGGAATTCAGCAGACCAGCCACCCCGATGCGGATTCGTGTGTGGAGGAGAGTTGCAGTTGCAGCGACGACTCCAACTCCAACGAGGGGATCCACGCCTGGACTGTTCTGTTCCAACGAGGGGATCCAACTCCAACTCAGCGGCAGGCAGCTAGCTGTCCTGTTCGAAATTCAAAACCCGGCCAGATCCGTGCTTGCGCTGCTCGCCGGGGCTGCTTTGTCCACTCAGGCCATCGATCTCCAGTTCCATGCGTGTGGTGGCGTTTGCTGGGCAGATCAGTTATTACTCCTCCACTCCACACCACTGCACCGGCCGGCACCGCTGGTAACGCACGCAGGTAGGCGGCCAAGGCCATGCCAATGTCATGCAGCGGGATTGATCCATGCGTCGTCCATTGGCGCCCTGCCCTCGGCTAGCTGCGGCT 2 0 5' arm Zea_mays mirnest MIR396 3e-90 osa-MIR396e 9e-16 -101.1 ((..(((((.((((((..((((((((((((((((.(((.(((((((.((((((..((((.(((((.((((((....(((((.(((.........))))))))..)))))).))))).))))))))))..((..........))..(((.((((.((((......)))).))))...)))(((((.......))))))))))))......))).))))))))))))))))..)))))).))))).)) (-101.1)