mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGGTGCATTGTAGTCGCATTG ATACAACTGCAGTGCAAGCTCC TGGAGCTGTGACGGAGGTGCATTGTAGTCGCATTGTCTGTATCCTTTATTCTCTGCGGCAATACAACTGCAGTGCAAGCTCCGTGCAGTTCAC 3 1 5' arm Drosophila_mojavensis mirbase mir-33 5e-34 dvi-mir-33 5e-24 -43.5 ..(((((((.((((((.(((((((((((.(.((((.(((((............))))))))).).)))))))))))..))))))))))))).. (-43.50)